Život Junipera Serry začal na středomořském ostrově Mallorca jako Miguel Jose Serra y Ferrer. Málo je známo o jeho raných letech kromě toho, že byly poznamenány nemocí. Jeho špatný zdravotní stav ho ale nezdržel. Serra vyrostla v náboženském prostředí a od raného věku projevovala hlubokou spiritualitu. I když stojí za zmínku, že podrobnosti o jeho dospívání zůstávají z velké části nezdokumentované. Jeho rodina žila jednoduše, což přispělo k rozvoji Serřiny skromné a soucitné povahy.
